在大掌门2的后期阶段，门派配偶组合的强度主要取决于弟子之间的合璧技能、缘分加成以及实战表现。西门吹雪与叶孤城的组合是当前版本中公认的顶级搭配，其合璧技能天外飞仙能造成极高的群体伤害，同时附带真气回复和绝击效果，在PVE和PVP中均有出色表现。燕南天与燕十三的组合则提供了强大的生存能力，燕南天的嫁衣技能可复活队友，燕十三的秒杀低气血目标能力则能有效补充伤害，两者结合形成攻守兼备的阵容核心。
李寻欢与阿飞的组合在后期同样具备竞争力，李寻欢的高额单体输出配合阿飞的保护能力，能快速击溃敌方关键目标。萧十一郎与沈璧君的合璧技能则以流血特效和控制效果为主，适合持久战，尤其在面对高血量敌人时优势明显。需配偶组合的强度并非绝对，还需考虑弟子培养度、装备搭配以及敌方阵容的针对性调整。合理的缘分激活和技能书选择能进一步提升组合的实战效果。
后期金将阵容中，西门吹雪、叶孤城、燕南天、燕十三、谢晓峰的搭配综合能力最强，谢晓峰的高频攻击与西门吹雪的群体爆发形成互补，燕南天和燕十三则确保队伍的生存能力。孟星魂与小蝶的组合在特定场景下表现突出，尤其是孟星魂的忽视防御特性，能有效克制高防敌人，但需投入较多资源培养。相比之下，萧十一郎为核心的阵容更适合遗迹挖掘等长线战斗，其持续伤害能力在消耗战中优势显著。
门派配偶组合的选择还需结合玩家自身资源与游戏进度。平民玩家可优先培养李寻欢或萧十一郎体系，因其成型较快且对资源需求相对较低；而高投入玩家则推荐西门吹雪体系，上限更高但依赖顶级装备和技能书支持。无论选择哪种组合，均需注重弟子间的缘分联动与技能循环，避免出现输出断层或生存短板。后期版本中，灵活调整阵容与战术才是制胜关键。
